Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI5

GRHL1, Grainyhead-like protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL1Q9NZI5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRHL1Q9NZI5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRHL1Q9NZI5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms