Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR7Q9NYK1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TLR7Q9NYK1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms