Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.581e-51■■■■□ 22.2
AATFQ9NY61 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.271e-51■■■■□ 22.2
AATFQ9NY61 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.151e-51■■■■□ 22.2
AATFQ9NY61 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.031e-51■■■■□ 22.2
AATFQ9NY61 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)14.99□□□□□ -0.011e-51■■■■□ 22.2
AATFQ9NY61 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.341e-51■■■■□ 22.2
AATFQ9NY61 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.491e-51■■■■□ 22.2
AATFQ9NY61 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.33□□□□□ -2.361e-51■■■■□ 22.2
AATFQ9NY61 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.492e-7■■■■□ 22.2
AATFQ9NY61 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 22.2
AATFQ9NY61 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 22.2
AATFQ9NY61 TMCO3-205ENST00000465556 314 ntTSL 314.66□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 22.2
AATFQ9NY61 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 222.38■■□□□ 1.173e-8■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.843e-8■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)17.09■□□□□ 0.333e-8■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.338e-7■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.448e-7■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 UNKL-207ENST00000403703 4281 ntTSL 1 (best)14.89□□□□□ -0.038e-7■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.642e-33■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.632e-33■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.262e-33■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 EEF1B2-205ENST00000429769 912 ntTSL 513.67□□□□□ -0.222e-33■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 EEF1B2-208ENST00000455150 670 ntTSL 57.51□□□□□ -1.212e-33■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 NAMPT-205ENST00000424768 1147 ntTSL 414.49□□□□□ -0.091e-7■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 NAMPT-203ENST00000393618 592 ntTSL 414.07□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 NAMPT-201ENST00000222553 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-7■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 NAMPT-206ENST00000441045 589 ntTSL 412.78□□□□□ -0.361e-7■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 NAMPT-204ENST00000417537 300 ntTSL 410.39□□□□□ -0.751e-7■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 NAMPT-213ENST00000491027 1009 ntTSL 210.13□□□□□ -0.791e-7■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 NAMPT-212ENST00000489732 1976 ntTSL 28.61□□□□□ -1.031e-7■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.611e-7■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 NAMPT-211ENST00000489358 581 ntTSL 34.79□□□□□ -1.641e-7■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 NAMPT-210ENST00000486949 1115 ntTSL 22.36□□□□□ -2.031e-7■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 EEF1A1-205ENST00000455918 701 ntTSL 224.4■■□□□ 1.57e-8■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.197e-8■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.387e-8■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 EEF1A1-201ENST00000309268 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.257e-8■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 EEF1A1-204ENST00000356303 635 ntTSL 210.93□□□□□ -0.667e-8■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.427e-8■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.577e-8■■■■□ 22.1
AATFQ9NY61 GUK1-234ENST00000492871 1065 ntTSL 331.5■■■□□ 2.631e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-215ENST00000462807 628 ntTSL 231.41■■■□□ 2.621e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-227ENST00000485083 871 ntTSL 330.51■■■□□ 2.471e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-235ENST00000493138 694 ntTSL 330.51■■■□□ 2.471e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.321e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.921e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.81e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-213ENST00000453943 656 ntTSL 1 (best)25.8■■□□□ 1.721e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.571e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.561e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-236ENST00000493209 735 ntTSL 523.58■■□□□ 1.371e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.251e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-230ENST00000485838 774 ntTSL 322.34■■□□□ 1.171e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.681e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-238ENST00000498092 865 ntTSL 518.73■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.541e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 GUK1-212ENST00000435153 865 ntTSL 315.12■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 22
AATFQ9NY61 TMC6-222ENST00000592076 693 ntTSL 319.8■□□□□ 0.761e-6■■■■□ 21.8
AATFQ9NY61 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.059e-15■■■■□ 21.8
AATFQ9NY61 GMPR-203ENST00000543191 675 ntTSL 212.42□□□□□ -0.429e-15■■■■□ 21.8
AATFQ9NY61 UNKL-206ENST00000402641 669 ntTSL 322.77■■□□□ 1.248e-7■■■■□ 21.7
AATFQ9NY61 TRIM28-212ENST00000597995 702 ntTSL 215.35■□□□□ 0.052e-7■■■■□ 21.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.541e-6■■■■□ 21.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 21.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 21.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 21.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.391e-6■■■■□ 21.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-222ENST00000442406 5129 ntTSL 1 (best)16.03■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 21.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 21.7
AATFQ9NY61 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 219.39■□□□□ 0.692e-6■■■■□ 21.7
AATFQ9NY61 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 21.7
AATFQ9NY61 XPO4-204ENST00000490513 914 ntTSL 424.78■■□□□ 1.568e-10■■■■□ 21.6
AATFQ9NY61 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.578e-10■■■■□ 21.6
AATFQ9NY61 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.988e-10■■■■□ 21.6
AATFQ9NY61 RPLP2-202ENST00000524867 598 ntTSL 230.93■■■□□ 2.541e-323■■■■□ 21.6
AATFQ9NY61 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.791e-323■■■■□ 21.6
AATFQ9NY61 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-323■■■■□ 21.6
AATFQ9NY61 RPLP2-208ENST00000532004 353 ntTSL 318.73■□□□□ 0.591e-323■■■■□ 21.6
AATFQ9NY61 SNORA52-201ENST00000362915 134 ntBASIC15.25■□□□□ 0.031e-323■■■■□ 21.6
AATFQ9NY61 RPLP2-206ENST00000530398 313 ntTSL 314.28□□□□□ -0.121e-323■■■■□ 21.6
AATFQ9NY61 RPLP2-203ENST00000525722 489 ntTSL 213.6□□□□□ -0.231e-323■■■■□ 21.6
AATFQ9NY61 RPLP2-204ENST00000526222 350 ntTSL 213.6□□□□□ -0.231e-323■■■■□ 21.6
AATFQ9NY61 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.311e-323■■■■□ 21.6
AATFQ9NY61 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.332e-7■■■■□ 21.5
AATFQ9NY61 MAPK15-206ENST00000484654 2240 ntTSL 1 (best)20.19■□□□□ 0.822e-7■■■■□ 21.5
AATFQ9NY61 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.792e-7■■■■□ 21.5
AATFQ9NY61 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.644e-12■■■■□ 21.5
AATFQ9NY61 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.462e-7■■■■□ 21.5
AATFQ9NY61 MAPK15-205ENST00000475376 351 ntTSL 311.7□□□□□ -0.542e-7■■■■□ 21.5
AATFQ9NY61 SNF8-208ENST00000510195 445 ntTSL 232.6■■■□□ 2.818e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SNF8-213ENST00000514929 775 ntTSL 529.91■■■□□ 2.388e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CD81-214ENST00000530239 425 ntTSL 229.71■■■□□ 2.358e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SNF8-217ENST00000576353 700 ntTSL 528.57■■■□□ 2.168e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MBD3-211ENST00000592965 568 ntTSL 428.47■■■□□ 2.158e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SNF8-209ENST00000510558 1051 ntTSL 528.08■■■□□ 2.098e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 28e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 UAP1L1-204ENST00000476184 645 ntTSL 327.12■■□□□ 1.938e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SNF8-216ENST00000573795 583 ntTSL 527.02■■□□□ 1.928e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 CD81-203ENST00000464784 794 ntTSL 526.95■■□□□ 1.98e-6■■■■□ 21.3
AATFQ9NY61 SMG1P3-202ENST00000437413 589 ntTSL 426.5■■□□□ 1.838e-6■■■■□ 21.3
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