Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM260Q9NX78 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms