Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms