Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB20Q9NX57 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms