Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCLQ9NW38 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCLQ9NW38 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCLQ9NW38 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCLQ9NW38 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCLQ9NW38 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCLQ9NW38 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCLQ9NW38 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCLQ9NW38 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCLQ9NW38 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCLQ9NW38 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCLQ9NW38 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCLQ9NW38 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms