Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX18Q9NVP1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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