Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANK4Q9NVE7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANK4Q9NVE7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms