Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBRD1Q9NUN5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMBRD1Q9NUN5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms