Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB4Q9NTQ9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB4Q9NTQ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJB4Q9NTQ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB4Q9NTQ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB4Q9NTQ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB4Q9NTQ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB4Q9NTQ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB4Q9NTQ9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB4Q9NTQ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms