Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.7 ms