Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN3Q9NQT6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms