Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQQ7

SLC35C2, Solute carrier family 35 member C2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C2Q9NQQ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35C2Q9NQQ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198 ms