Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD3Q9NPG1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD3Q9NPG1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms