Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRM3Q9NNZ6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRM3Q9NNZ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRM3Q9NNZ6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRM3Q9NNZ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRM3Q9NNZ6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRM3Q9NNZ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRM3Q9NNZ6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRM3Q9NNZ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRM3Q9NNZ6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRM3Q9NNZ6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRM3Q9NNZ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRM3Q9NNZ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms