Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD33

MRPL47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL47Q9HD33 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL47Q9HD33 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL47Q9HD33 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms