Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLD4Q9HCU8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD4Q9HCU8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms