Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CBX8Q9HC52 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms