Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY9Q9HBG7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms