Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms