Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR1BQ9H9Y6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1BQ9H9Y6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms