Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9H4

VPS37B, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37BQ9H9H4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS37BQ9H9H4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37BQ9H9H4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms