Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
REEP1Q9H902 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP1Q9H902 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms