Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SCAF1Q9H7N4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAF1Q9H7N4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms