Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A3Q9H7F0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms