Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSS3Q9H6R3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms