Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF39Q9H2S5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms