Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EHD4Q9H223 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EHD4Q9H223 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms