Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms