Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms