Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM2Q9BVW6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms