Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB6Q9BUF5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms