Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MKNK1Q9BUB5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKNK1Q9BUB5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms