Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCMBPQ9BTE3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.7 ms