Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms