Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC39A3Q9BRY0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A3Q9BRY0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms