Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms