Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PYM1Q9BRP8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PYM1Q9BRP8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYM1Q9BRP8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms