Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPPED1Q9BRF8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms