Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF4Q9BQW3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EBF4Q9BQW3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 387.1 ms