Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOPXQ9BPY8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOPXQ9BPY8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOPXQ9BPY8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms