Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID3AQ99856 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3AQ99856 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms