Protein–RNA interactions for Protein: Q99748

NRTN, Neurturin, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTNQ99748 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRTNQ99748 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NRTNQ99748 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms