Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RIT2Q99578 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RIT2Q99578 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIT2Q99578 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms