Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHOX2BQ99453 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHOX2BQ99453 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms