Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MMS19Q96T76 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMS19Q96T76 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMS19Q96T76 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms