Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PNKPQ96T60 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNKPQ96T60 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNKPQ96T60 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms