Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM209Q96SK2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM209Q96SK2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms