Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN18Q96SJ8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms